Nature Figure Skill 技能
为科研论文制作可直接投稿的图表
Nature Figure:为科研论文制作可直接投稿的图表
技能简介
Nature Figure 是一款面向科研制图的 Agent 技能,针对一个常见痛点:科研图表做不好,往往不是画图技术不行,而是"叙事、证据、导出、复核"四个环节彼此割裂。研究结论怎么用图讲清楚、证据层级如何组织、导出格式是否符合期刊要求、投稿前该复核什么,这些问题散落在不同步骤里,最终导致返修。
该技能把这些环节串成一条可投稿的完整工作流,引导 Claude、Codex、Claude Code 先规划图表契约,再生成代码,最后做质量检查。它要求使用者在 Python 与 R 之间明确选择一条后端路线,并保持后端独占,避免两套输出混用。技能版本 2.0.0,MIT 许可,质量评级 gold。
核心能力
- 强制选择后端:在生成图表代码前,必须先在 Python 与 R 之间做出选择,保证绘图、预览与质检同源。
- 构建图表契约:明确核心结论、证据层级、面板图、导出目标与复核风险,先想清楚再画图。
- Python 制图指引:覆盖 matplotlib、seaborn、subplot_mosaic、可编辑 SVG 与位图预览。
- R 制图指引:覆盖 ggplot2、patchwork、ComplexHeatmap、svglite、cairo_pdf 与 ragg 导出。
- 参考示例与图谱:内置参考演示与图表图谱,帮助快速搭建多面板科研图布局。
- 质量检查流水线:对源数据可追溯性、字体排版、配色、统计标注与导出格式运行 QA 检查。
安装配置
- 安装技能:执行
npx skillstore add yuan1z0825/nature-figure将技能加入本地技能库。 - 确定绘图后端:在 Python 与 R 之间选定一个后端,并在后续绘图、预览与质检中保持一致。
- 准备真实数据:提供真实数据、标签、单位以及目标图表的结论,不要用模拟数据代替。
- 确认导出目标:明确目标期刊与导出格式,通常需要可编辑的 SVG 或 PDF 加一份位图预览。
使用步骤
- 规划图表:说明需要 Python 或 R 的论文图、核心结论是什么、数据列有哪些,先完成规划再写代码。
- 生成绘图代码:指定后端,从数据框构建多面板图,并导出可编辑 SVG 与 PNG 预览。
- 审计已有图:对现有图做可读性、统计标注、配色、排版、源数据可追溯性与导出质量审查,返回按优先级排序的修改项。
- 把示例改造为投稿图:选取最接近的内置示例模式,套用到真实数据与论文结论上,不沿用示例标签或暴露内部路径。
- 导出并复核:导出可编辑 SVG 或 PDF 加位图预览,并核对源数据可追溯性与统计标注。
适用场景
- 规划手稿配图:把一项研究主张转化为面板图、证据层级、导出方案与复核清单。
- 返修已投稿图表:在重新提交前,审计排版、统计、配色、源数据说明与期刊要求的输出格式。
- 构建方法对比面板:把内置的科研图表模式改造成干净的方法对比图,适配真实项目数据。
- 多面板复杂图布局:需要把热图、统计图与分组对比整合到一张图里时,用图谱快速搭骨架。
适用人群
适合高校与科研机构的硕博研究生、博后、课题组成员,以及需要按期刊规范产出配图的科研人员。凡是"数据有了、但图总被审稿人挑格式"的情况,都值得一试。
工作原理
技能采用"契约先行"的工作方式:先确定图表要传达的核心结论与证据链,再规划面板结构、导出目标与复核风险,之后才生成绘图代码。它把 Python 与 R 的制图规范分别沉淀为指引,并在最后运行一套 QA 检查,覆盖源数据可追溯、字体排版、配色、统计标注与导出格式。所有生成物在本地产出,示例中的私有模板路径与内部文件名不会出现在最终交付内容里。
注意事项
- 它不替代科学判断、统计复核与期刊编辑要求。
- 需要使用者提供真实数据、标签、单位与目标图表结论。
- 不支持仪表盘或 Illustrator 优先的信息图。
- 不要在某后端未选定或目标不清晰的情况下生成模拟数据。
- 未经使用者同意,不要在一张图里混用 Python 与 R 的输出。
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