近二十亿,只为把数据铺开

小白爱摸鱼 @chaozuoye

biohub.org/news/virtual-b…

Google DeepMind 把手伸向了生物学的地基,落点不在模型,在数据。

宣布摆开。话说得很直,构建预测性生物学模型是这个时代最重要的科学挑战之一,而解它需要前所未有的大规模新实验生物数据。说这话的是 Google Cloud 首席科学家、DeepMind 副总裁 Pushmeet Kohli。他宣布 DeepMind 将与 Chan Zuckerberg 的虚拟生物学计划联手,造出改进预测性生物模型所需的多模态数据集。

底下那层逻辑也交代了。生命要在多个尺度上才看得懂,从 DNA 和单个蛋白质,到活细胞,再到整体健康;AlphaFold 和 Protein Data Bank 走过的路给了同一条教训,没有高质量的开放数据,重大的生物学难题根本解不开。

公告那张卡片把价码也亮了出来。跨国跨部门的协作承诺投入接近二十亿美元,Biohub、能源部、国立卫生研究院和伙伴一起生成开放、标准化的数据。这些数据拿来训练模型,目标是预测细胞如何响应干预。

文末一串名字排开,艾伦研究所、布罗德研究所、格拉德斯通、人类细胞图谱、蛋白质图谱、桑格尔研究所、Isomorphic Labs、Meta。

"先备数据、再谈模型"这半句是全场重心。前面一百二十亿超了原定目标讲的是把钱备进产能,这条讲的是把钱铺进语料。跟前面一个空间三种检索呼应,那条管怎么找,这条管找什么,两头都在给下一批模型备原料。跟前面给奖励加一层也接得上,一个把准绳装进训练,一个把原料倒进训练,同一条链子的前后两端。

AlphaFold 那句教训我单拎出来记,当年赢在算法,如今要补的是数据,这说明到了某个阶段,瓶颈会从聪明挪到勤奋。

我留的疑问有三处。二十亿的分配比例没给;数据集的发布节奏没排期;参与的机构各自出什么也没数。

这周把公告那篇 biohub.org/news/virtual-b… 和他那篇尺度文章 linkedin.com/pulse/understa… 都读完,看自己这边最缺的是哪一层数据。

话题来源 @pushmeet 18.6K阅读 ❤️318 x.com/…↗ 已改写,非原文转载 Open data for predictive AI models of biology: $1.8 billion committed Biohub, DOE, NIH, and partners will generate open, standardized data to train AI models that predict how cells respond to interventions. Biohub
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